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La infección por VIH puede simular diversas enfermedades más. El diagnóstico diferencial específico depende del modo de presentación. En pacientes que presentan síntomas constitucionales como pérdida de peso y fiebres, las consideraciones diagnósticas incluyen cáncer, infecciones crónicas como tuberculosis o endocarditis, y trastornos endocrinos como hipertiroidismo. Cuando los trastornos pulmonares dominan el cuadro clínico, deben considerarse las infecciones pulmonares agudas y crónicas, además de otras causas de infiltrados pulmonares intersticiales difusos. Cuando el modo de presentación es la enfermedad neurológica, deben considerarse los trastornos que producen cambios en el estado mental o neuropatía, como alcoholismo, enfermedad hepática, disfunción renal, enfermedad tiroidea y deficiencia de vitaminas. Si un paciente se presenta con cefalea y pleocitosis en el líquido cefalorraquídeo, se incluyen otras causas de meningitis crónica en el diagnóstico diferencial. Cuando la diarrea es un problema prominente, deben considerarse enterocolitis infecciosa, colitis asociada con antibióticos, enfermedad intestinal inflamatoria y síntomas de malabsorción.